Typeringslab
Aanleiding
Aanleiding voor het Typeringslab is om vermijdbare schade en sterfte door infecties met resistente bacteriën in Limburg zoveel mogelijk te voorkomen. Dit vereist regionale beheersing van de verdere ontwikkeling en verspreiding van (multi)resistentie, zodat effectieve behandeling van infecties met antibiotica ook in de toekomst mogelijk blijft. Een belangrijke activiteit binnen dit proces is het typeren van bacteriestammen.
Doelen
Het doel is het opzetten van een regionaal typeringsnetwerk, dat gebruikt kan worden voor infectiepreventie.
- De eerste doelstelling van het project is het onderzoeken van het effect van snelle typering (binnen 2 werkdagen) op infectiepreventiemaatregelen. Dit helpt beginnende uitbraken van infectieziekten te herkennen, interventies in te zetten en verdere verspreiding te voorkomen.
- De tweede doelstelling is het opzetten van een database waarin typeringsdata en methoden snel beschikbaar zijn voor ziekenhuizen. Hierdoor kunnen data tussen ziekenhuizen vergeleken worden, en kunnen mogelijke uitbraken die meerdere ziekenhuizen overstijgen, tijdig worden opgespoord.
Hoe?
1e fase (2020 - 2022):
In deze fase is een regionale database opgezet, waarin typeringsdata van Enterobacteriaceae-isolaten uit vier ziekenhuizen met elkaar werd gedeeld. De isolaten werden verzameld en geanalyseerd met drie typeringsmethoden: twee snelle technieken met lagere resolutie en WGS-sequencing met Illumina. De WGS-data werd opgeslagen in een database gefaciliteerd door het Zweedse bedrijf 1928. Elk ziekenhuis had toegang tot zijn eigen data en kon deze vergelijken met isolaten uit de regio.
Uit de analyse van ongeveer 180 isolaten bleek dat er grote verschillen waren in de clustering van de isolaten door de drie typeringsmethoden. De snelle methoden kunnen vaak niet bevestigd worden d.m.v de trage methoden met meer resolutie (WGS). Daarom lijkt het zinvol om in te zetten op het versnellen en goedkoper uitvoeren van de WGS, dan om de andere twee technieken te blijven toepassen.
2e fase (vanaf 2023)
De jaren 2020 tot 2022 werden beïnvloed door de coronapandemie, waardoor veel infectiepreventiemaatregelen anders waren dan gebruikelijk. Het project wordt nu voortgezet om de borging en testprocedures te versterken. In deze fase zal de focus liggen op de inzameling van VRE- en ESBL-Enterobacteriaceae-isolaten, specifiek gericht op infectiepreventie en het voorkomen en tijdig herkennen van mogelijke verspreiding. Dit regionale toezicht is een aanvulling op de landelijke surveillance en heeft als doel om resistentiepatronen die buiten de landelijke surveillance vallen, vroegtijdig te signaleren. Hierdoor kunnen maatregelen worden genomen om verspreiding naar andere regio's te voorkomen en te voorkomen dat een resistente BRMO een landelijk probleem wordt.
Toekomst
In het komende jaar zal het IP & AMR Zorgnetwerk Limburg onderzoeken hoe een systeem van decentraal typeren met centrale gegevensverwerking opgezet kan worden. Dit zal een vroege signaleringsfunctie naar een landelijke database mogelijk maken en bijdragen aan snellere interventies bij opkomende uitbraken.